Skip Navigation Linksلیست مقالات ترجمه شده / مقالات ترجمه شده مهندسی كامپيوتر /

عنوان ترجمه شده مقاله: تحلیل کمی کاربردهای تطبیق توالی در مورد معماری های چندپردازنده

در این تحقیق بررسی می کنیم که چگونگی کاربردهای بیوانفورماتیک از معماری موازی که روش های متفاوتی را برای موازی سازی ضخیم و با بافت خوب به کار می بندد، بهره مند می شود
Abstract

The exponential growth of databases that contains biological information (such as protein and DNA data) demands great efforts to improve the performance of computational platforms. In this work we investigate how bioinformatics applications benefit from parallel architectures that combine different alternatives to exploit coarse- and fine-grain parallelism. As a case of analysis we study the performance behavior of the search application that implements the Smith-Waterman algorithm, which is a dynamic programing approach that explores the similarity between a pair of sequences. The inherent large parallelism of the algorithm makes it ideal for architectures supporting multiple dimensions of parallelism (TLP, DLP and ILP). We study how this algorithm can take advantage of different parallel machines like the SGI Altix, IBM Power6, Cell BE machines and MareNostrum. Our results show that a share memory architecture like the PowerPC 970MP of Marenostrum can surpass a heterogeneous machine like the current Cell BE. Our quantitative analysis includes not only a study of scalability of the performance in terms of speedup, but also includes the analysis of bottlenecks in the execution of the application. This analysis is carried out through the study of the execution phases that the application presents

چکیده

رشد تصاعدی پایگاه داده هایی که محتوی مقادیر اطلاعات زیستی (مانند اطلاعات پروتئین و DNA) هستند، نقش بسزایی در بهبود عملکرد پلتفرم های محاسباتی دارند. در این تحقیق بررسی می کنیم که چگونگی کاربردهای بیوانفورماتیک از معماری موازی که روش های متفاوتی را برای موازی سازی ضخیم و با بافت خوب به کار می بندد، بهره مند می شود. به عنوان یک مورد تحلیلی ما وضعیت عملکرد روش جستجوی S را مورد مطالعه قرار می دهیم که الگوریتم Smith – Waterman که خود یک روش برنامه نویسی دینامیک تعیین کننده شباهت های بین یک جفت توالی است را اجرا می کند. موازی سازی ذاتی گسترده این الگوریتم، آن را برای معماری های پشتیبانی کننده از انواع چندگانه موازی سازی (TLP، DLP و ILP) ایده آل می سازد. ما بررسی می کنیم که چگونه این الگوریتم می تواند از ماشین های موازی مختلف مانند SGI Altix، IBM Power6، ماشین های BE و MareNostrum سوء استفاده کند. نتایج ما نشان می دهد که یک معماری اشتراک حافظه مانند PowerPC 970MP مربوط به Marenostrum می تواند بهتر از ماشین غیر همگن نظیر Cell BE اخیر باشد. تحلیل کمی نه تنها شامل مطالعه در مورد مقیاس پذیری عملکرد بر‌حسب افزایش سرعت می باشد، بلکه همچنین شامل بررسی مشکل در اجرای برنامه کاربردی می شود. این تحلیل از طریق مطالعه مراحل اجرایی که برنامه کاربردی ارائه می دهد، انجام می شود.

1-مقدمه

توسعه روزافزون علم بیوانفورماتیک به عنوان یک تکنولوژی نوظهور، توجه حوزه های مختلف علوم (زیست شناسی، ریاضیات، طراحی سخت افزار، علوم کامپیوتر و غیره) را به خود جلب کرده است. در این شرایط، رشد تصاعدی اطلاعات زیستی به تحقیق و توسعه بررسی چندین روش الگوریتمی برای پردازش موثر آن داده ها نیازمند می باشد...


موسسه ترجمه البرز اقدام به ترجمه مقاله " مهندسی فناوری اطلاعات " با موضوع " تحلیل کمی کاربردهای تطبیق توالی در مورد معماری های چندپردازنده " نموده است که شما کاربر عزیز می توانید پس از دانلود رایگان مقاله انگلیسی و مطالعه ترجمه چکیده و بخشی از مقدمه مقاله، ترجمه کامل مقاله را خریداری نمایید.
عنوان ترجمه فارسی
تحلیل کمی کاربردهای تطبیق توالی در مورد معماری های چندپردازنده
نویسنده/ناشر/نام مجله :
Proceedings of the 6th ACM conference on Computing frontiers
سال انتشار
2009
کد محصول
1009351
تعداد صفحات انگليسی
10
تعداد صفحات فارسی
32
قیمت بر حسب ریال
1,232,000
نوع فایل های ضمیمه
Pdf+Word
حجم فایل
1 مگا بایت
تصویر پیش فرض


این مقاله ترجمه شده را با دوستان خود به اشتراک بگذارید
سایر مقالات ترجمه شده مهندسی فناوری اطلاعات , مهندسی كامپيوتر را مشاهده کنید.
کاربر عزیز، بلافاصله پس از خرید مقاله ترجمه شده مقاله ترجمه شده و با یک کلیک می توانید مقاله ترجمه شده خود را دانلود نمایید. مقاله ترجمه شده خوداقدام نمایید.
جهت خرید لینک دانلود ترجمه فارسی کلیک کنید
جستجوی پیشرفته مقالات ترجمه شده
برای کسب اطلاعات بیشتر، راهنمای فرایند خرید و دانلود محتوا را ببینید
هزینه این مقاله ترجمه شده 1232000 ریال بوده که در مقایسه با هزینه ترجمه مجدد آن بسیار ناچیز است.
اگر امکان دانلود از لینک دانلود مستقیم به هر دلیل برای شما میسر نبود، کد دانلودی که از طریق ایمیل و پیامک برای شما ارسال می شود را در کادر زیر وارد نمایید


این مقاله ترجمه شده مهندسی فناوری اطلاعات در زمینه کلمات کلیدی زیر است:





Algorithms
Measurement
Performance
Multiprocessor Architectures

تاریخ انتشار در سایت: 2016-11-22
جستجوی پیشرفته مقالات ترجمه شده
نظرتان در مورد این مقاله ترجمه شده چیست؟

ثبت سفارش جدید